Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9DAE8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9DAE8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms