Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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