Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Cldn22Q9D7U6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Cldn22Q9D7U6 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Cldn22Q9D7U6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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