Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Rep15Q9D7T1 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Rep15Q9D7T1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Rep15Q9D7T1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Rep15Q9D7T1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Rep15Q9D7T1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Rep15Q9D7T1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Rep15Q9D7T1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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Rep15Q9D7T1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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