Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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