Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc7Q9D541 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc7Q9D541 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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