Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms