Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms