Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Shisa9Q9CZN4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms