Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Trim13Q9CYB0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Trim13Q9CYB0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Trim13Q9CYB0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Trim13Q9CYB0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Trim13Q9CYB0 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Trim13Q9CYB0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Trim13Q9CYB0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Trim13Q9CYB0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Trim13Q9CYB0 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Trim13Q9CYB0 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Trim13Q9CYB0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Trim13Q9CYB0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Trim13Q9CYB0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Trim13Q9CYB0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim13Q9CYB0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Trim13Q9CYB0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms