Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcbQ9CXT8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcbQ9CXT8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms