Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cnih4Q9CX13 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cnih4Q9CX13 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih4Q9CX13 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih4Q9CX13 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih4Q9CX13 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih4Q9CX13 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cnih4Q9CX13 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cnih4Q9CX13 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cnih4Q9CX13 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cnih4Q9CX13 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cnih4Q9CX13 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih4Q9CX13 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih4Q9CX13 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih4Q9CX13 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih4Q9CX13 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnih4Q9CX13 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnih4Q9CX13 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnih4Q9CX13 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnih4Q9CX13 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Cnih4Q9CX13 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnih4Q9CX13 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Cnih4Q9CX13 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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