Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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