Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ddx28Q9CWT6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ddx28Q9CWT6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ddx28Q9CWT6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ddx28Q9CWT6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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Ddx28Q9CWT6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ddx28Q9CWT6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ddx28Q9CWT6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ddx28Q9CWT6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ddx28Q9CWT6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ddx28Q9CWT6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ddx28Q9CWT6 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ddx28Q9CWT6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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