Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rhobtb3Q9CTN4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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