Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q9CRC3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q9CRC3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Q9CRC3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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