Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Rdm1Q9CQK3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rdm1Q9CQK3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdm1Q9CQK3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rdm1Q9CQK3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rdm1Q9CQK3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Rdm1Q9CQK3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rdm1Q9CQK3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdm1Q9CQK3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rdm1Q9CQK3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rdm1Q9CQK3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rdm1Q9CQK3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rdm1Q9CQK3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rdm1Q9CQK3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rdm1Q9CQK3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rdm1Q9CQK3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rdm1Q9CQK3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rdm1Q9CQK3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rdm1Q9CQK3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rdm1Q9CQK3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rdm1Q9CQK3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rdm1Q9CQK3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rdm1Q9CQK3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rdm1Q9CQK3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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