Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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