Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQC3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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