Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms