Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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Smim3Q99PE5 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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