Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms