Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hdac9Q99N13 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hdac9Q99N13 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hdac9Q99N13 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hdac9Q99N13 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hdac9Q99N13 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hdac9Q99N13 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Hdac9Q99N13 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Hdac9Q99N13 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Hdac9Q99N13 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Hdac9Q99N13 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms