Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms