Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms