Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms