Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Krcc1Q99JT5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms