Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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