Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Pde11a-201ENSMUST00000099992 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Cacna1d-209ENSMUST00000224785 8041 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Ccdc141-207ENSMUST00000164114 6222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Adam22-206ENSMUST00000115386 9056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Sbf2-201ENSMUST00000033058 7154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Nvl-201ENSMUST00000027797 9392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Igf1r-201ENSMUST00000005671 11409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Akap2-204ENSMUST00000102902 6993 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms