Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gtpbp3Q923K4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gtpbp3Q923K4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gtpbp3Q923K4 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms