Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sf3b5Q923D4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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