Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Med28Q920D3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms