Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap22-2-201ENSMUST00000178913 380 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Uchl4-201ENSMUST00000039011 1162 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6460-201ENSMUST00000088616 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms