Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rdh10Q8VCH7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rdh10Q8VCH7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rdh10Q8VCH7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rdh10Q8VCH7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rdh10Q8VCH7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rdh10Q8VCH7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rdh10Q8VCH7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rdh10Q8VCH7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rdh10Q8VCH7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rdh10Q8VCH7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rdh10Q8VCH7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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