Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms