Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm1Q8K377 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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