Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ssh3Q8K330 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ssh3Q8K330 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ssh3Q8K330 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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