Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms