Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms