Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc73Q8CDM4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc73Q8CDM4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc73Q8CDM4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc73Q8CDM4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc73Q8CDM4 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc73Q8CDM4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc73Q8CDM4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc73Q8CDM4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc73Q8CDM4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc73Q8CDM4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc73Q8CDM4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc73Q8CDM4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc73Q8CDM4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc73Q8CDM4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ccdc73Q8CDM4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms