Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufl1Q8CCJ3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms