Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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