Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Alx1Q8C8B0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx1Q8C8B0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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