Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms