Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5P7

Tdrp, Testis development-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrpQ8C5P7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TdrpQ8C5P7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms