Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc21aQ8C0S4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 583.8 ms