Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek11Q8C0Q4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms