Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trim35Q8C006 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trim35Q8C006 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 4930579M01Rik-201ENSMUST00000130943 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trim35Q8C006 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trim35Q8C006 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trim35Q8C006 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trim35Q8C006 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trim35Q8C006 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trim35Q8C006 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Il1f5-202ENSMUST00000114490 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trim35Q8C006 Gm3550-201ENSMUST00000105038 1656 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm44080-201ENSMUST00000204451 2214 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm11565-201ENSMUST00000105053 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm43802-201ENSMUST00000197826 637 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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