Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp5Q8BX09 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms