Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp2Q8BX07 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms